Benedykt XVI mianował prefekta Kongregacji Nauki Wiary, czyli swego następcę na tym kluczowym watykańskim urzędzie, sięgającym czasów tzw. Świętej Inkwizycji i pilnującym zgodności nauczania w imieniu Kościoła rzymskokatolickiego z doktryną. Joseph Ratzinger wybrał na następcę arcybiskupa San Francisco jezuitę Williama J. Levadę, uważanego za jednego z najlepszych współczesnych katolickich eklezjologów (specjalistów nauki o Kościele). Levada napisał doktorat o prawie naturalnym w świetle nauczania Kościoła, pracował w Kongregacji Wiary w latach 1976–1982, od 2000 r. był jej członkiem, ale od ponad 20 lat przebywał poza Kurią Rzymską, zajmując ważne stanowiska kościelne w Kalifornii. Oznacza to, że ma już wielkie doświadczenie, ale przybywa do Rzymu jako człowiek z zewnątrz, czyli niezależny od watykańskich grup interesu – trochę tak, jak kardynał Ratzinger, kiedy w 1981 r. obejmował Kongregację. Levada wyróżnił się pracą w komisji, która przygotowała zasady postępowania z księżmi w USA oskarżanymi o nadużycia seksualne. To, że papież powołał biskupa San Francisco, legendarnej stolicy hipisów, bohemy i gejów, wskazuje, że chciał nie tylko eksperta od dylematów bioetyki, ale także kogoś, kto dobrze zna świat pochrześcijański.