1. Wojna z Gdańskiem (1577)
Przebieg: Stefan Batory wchodzi w konflikt z największym miastem Rzeczpospolitej, które nie uznaje jego koronacji, opowiadając się za Maksymilianem Habsburgiem. Gdańsk zaciąga silną armię, której dowództwo powierza słynnemu kondotierowi Hansowi Winkelbruchowi z Kolonii. Batory wysyła wojska dowodzone przez hetmana nadwornego Jana Zborowskiego. W bitwie nad Jeziorem Lubieszowskim (17.04.) husaria pod dowództwem Mikołaja Żółkiewskiego doszczętnie rozbija czterokrotnie liczniejszego przeciwnika. Gdańsk kapituluje.
Skutki: Pomimo militarnej klęski i ogromnej kontrybucji Gdańsk utrzymał większość swoich dotychczasowych przywilejów handlowych.
2. Wojna z Moskwą o Inflanty (1577–1581)
Przebieg: W 1577 r. car Iwan IV Groźny atakuje polskie Inflanty i zajmuje tereny aż po Dźwinę. Król Stefan Batory trzykrotnie podejmuje wielkie kampanie przeciwko Moskwie: wyprawę na Połock w 1579 r., na Wielkie Łuki w 1580 r. i na Psków w 1581 r.
Skutki: Pokój w Jamie Zapolskim w 1582 r. Rzeczpospolita uzyskała Połock i utrzymała posiadaną wcześniej część Inflant.
3. Wojna domowa i interwencja austriacka (1587–1588)
Przebieg: Niemal jednoczesny wybór dwóch królów: Zygmunta Wazy i arcyksięcia Maksymiliana Habsburga wywołuje wojnę domową. Po stronie Zygmunta staje hetman Jan Zamoyski, który w listopadzie odpiera spod murów Krakowa armię arcyksięcia i jego polskich stronników (Zborowscy, Diabeł Stadnicki, Stanisław Górka).